Det händer ibland att Musa basjoo drabbas av röta under vintern. Vanligtvis är det röta som har uppstått till följd av köldskador och som sprider sig ner i stammen. Ofta går det att rädda stammen genom att skära bort det som är rötskadat. Om rötan istället har uppstått nere vid stambasen, är det värre, och anledningen kan vara övervattning. Om stammarna har ruttnat, kan bananplantan skjuta nya skott från marken, under förutsättning att det fortfarande finns liv i jordstammarna under marken.